La taxonomie est la science qui a pour but de nommer et de classer le vivant.
Historique
La taxonomie moderne a vu le jour en 1735, quand Linné ( Carl Linnaeus) a créé un système permettant de classer tous les organismes vivants connus à son époque, c’est à dire visibles. Il l’a fait en donnant à chaque espèce un nom latin en deux parties. Ce nom est également appelé nom scientifique.
La classification linnéenne
Linné classe les organismes vivants en deux groupes, appelés règnes, basés sur la capacité de déplacement de l’organisme : il définit donc le règne végétal et le règne animal.
Dans chaque règne, il regroupe les organismes par similitudes en sous-groupes : les classes, les ordres, les genres et les espèces.
Suite à la mise au point du microscope, d’autres organismes sont découverts et ne peuvent pas être classés dans le système de Linné.
Un système de classification à 5 règnes est proposé en 1969. Un autre est proposé en 1977, divisant les microorganismes unicellulaires qui ne possèdent pas de noyau en deux règnes distincts.
Enfin, en 1990, une classification basée sur la structure de l’acide ribonucléique (ARN) met en avant trois domaines qui regroupent les six règnes.
classifications des organismes vivants
Les arbres se trouvent donc dans le règne Plantea.
Comme ce sont des plantes à graines, ils sont rangés dans l’ordre des Phanerogams.
On distingue ensuite les arbres qui ne produisent pas de fleur et dont les graines sont nues dans l’embranchement des Gymnosperms ; ce sont les conifères et les ginkgos, et les arbres feuillus, qui produisent des fleurs et dont les graines sont protégées dans un ovaire dans l’embranchement des Angiosperms.
Parmi les angiosperms, on distingue deux classes : les monocotylédones et les dicotylédones, possédant deux cotylédons –premières feuilles de la plante– présents dans la graine et qui contiennent les réserves nécessaires à la plantule pour se développer avant d’avoir des racines et des feuilles fonctionnelles. C’est parmi les dicotylédones que sont regroupés tous les arbres feuillus.
Dans les gymnosperms, les conifères, qui ont souvent cinq cotylédons ou davantage appartiennent tous à la classe des coniféropsides, à l’exception des Taxus, qui appartiennent à la classe des taxopsides.
classifications des arbres et arbustes
Dans chaque classe, les arbres sont regroupés en famille en fonction de caractéristiques communes : Fagacaeae, Betulaceae, Pinaceae, …
A l’intérieur de ces familles, les arbres sont classés par genre puis par espèce. L’espèce est toujours le nom latin en deux parties proposé par Linné.
Le nom latin de l’espèce renseigne sur :
- l’origine de l’espèce : chinensis, atlantica, …
- le milieu où vit l’espèce : campestre, sylvatica, …
- les particularités du feuillage : pentaphylla, sempervirens, …
- La personne à l’origine de la description de l’espèce, ou une personne que le descripteur veut honorer : buergerianum, …
Pour les variétés cultivés par l’homme, et dont les caractéristiques sont fixées, le nom de l’espèce est suivi du nom du cultivar.
La classification phylogénétique
L’essor des capacités d’analyses génétiques des organismes vivants a amené à une classification nouvelle basée sur la parenté génétique, plutôt que sur des ressemblances externes des classifications linnéenes.
On y retrouve les notions de bases de la classification classique (règne, classe,ordre,famille,espèce), mais le classement interne des organismes dans chaque niveau est basée sur la notion de clade :
Un clade est un groupe qui comprend :
- Un ancêtre commun,
- Tous les descendants de cet ancêtre.
Cette définition implique que les membres d’un clade partagent une histoire évolutive commune et sont plus étroitement apparentés entre eux qu’avec tout autre groupe extérieur.
Les clades sont imbriqués les uns dans les autres en fonction de l’évolution, formant graphiquement un arbre appelé cladogramme.
L’évolution des connaissances scientifiques peut amener à une modification de la définition d’un clade, rendant le cladogramme dynamique.
Exemple de classification du pin à crochets
Le pin à crochets est décrit comme suit :
pin à crochets : classification linnéenne
pin à crochets : classification phylogénétique